È stata la chiesa principale di un convento femminile. Esiste ancora un’iscrizione di marmo del 1687 che si riferisce alla ristrutturazione della chiesa. La chiesa ha ottenuto la sua forma presente durante la ristrutturazione avviata nel 1816 e terminata nel 1821.
Il quadro della Madonna tenuto nella chiesa, è legato a storie di pirati e leggende di Folegandros. Secondo una vecchia usanza di Folegandros, a Pasqua si fa la processione del quadro della Madonna in tutte le case dell’isola.
Per arrivare alla Chiesa si deve seguire il sentiero che parte dalla piazza di Punta (15 ‘).